Odjeljenje za sudbenu upravu pruža usluge potpore Sudu BiH i sastoji se od Ureda za informacije i dokumente i Ureda za potporu suđenjima. Neki od glavnih zadataka Odjeljenja za sudbenu upravu su sljedeći:

• nadgleda prijam, procesuiranje, arhiviranje i distribuciju dokumenata, predmeta i svih sudbenih spisa Odjela I i Odjela II (uključujući spise predmeta, dokazne materijale dostavljene u postupku i arhivu);
• osigurava sustave za koordinaciju predmeta;
• osigurava integritet i sigurnost podataka;
• upravlja elektronskim sustavima i bazama podataka sudbenih predmeta;
• priprema zapisnike suđenja i osigurava snimanje sudbenih procesa (kao što su zapisnici, transkripti i video zapisi);
• priprema i rukovodi statističkim podacima o radu Suda;
• vodi i distribuira raspored suđenja i korištenja sudnica;
• izrađuje i realizira tehnološki sustav kojim su opremljene sudnice kao i sustav potpore suđenjima zajedno sa Odjeljenjem za informacionu tehnologiju;
• održava tehničke kapaciteta za simultano prevođenje na sva tri jezika BiH za suđenja u kojima sudjeluju strani državljani;
• koordinira uporabu tehnoloških sustava kako bi se osiguralo efikasno i nesmetano vođenje sudbenih postupaka;
• pruža potporu predsjednici Suda i sucima u planiranju i upravljanju sudbenim postupcima i općenito u radu odjeljenja.