Odjeljenje za sudsku upravu pruža usluge podrške Sudu BiH i sastoji se od Ureda za informacije i dokumente i Ureda za podršku suđenjima. Neki od glavnih zadataka Odjeljenja za sudsku upravu su sljedeći:

• nadgleda prijem, procesuiranje, arhiviranje i distribuciju dokumenata, predmeta i svih sudskih spisa Odjela I I Odjela II (uključujući spise predmeta, dokazne materijale dostavljene u postupku i arhivu);
• osigurava sisteme za koordinaciju predmeta,
• osigurava integritet i sigurnost podataka
• upravlja elektronskim sistemima i bazama podataka sudskih predmeta
• priprema zapisnike suđenja i osigurava snimanje sudskih procesa (kao što su zapisnici, transkripti i video zapisi);
• priprema i rukovodi statističkim podacima o radu Suda
• vodi i distribuira raspored suđenja i korištenja sudnica;
• izrađuje i realizira tehnološki sistem kojim su opremljene sudnice kao i sistem podrške suđenjima zajedno sa Odjeljenjem za informacionu tehnologiju;
• održava tehničke kapaciteta za simultano prevođenje na sva tri jezika BiH za suđenja u kojima učestvuju strani državljani;
• koordinira upotrebe tehnoloških sistema kako bi se osiguralo efikasno i nesmetano vođenje sudskih postupaka;
• pruža podršku predsjednici Suda i sudijama u planiranju i upravljanju sudskim postupcima i općenito u radu odjeljenja.

Odjeljenje za sudsku upravu realizovao je sistem automatske dodjele predmeta, kao dio realizacije novog sistema Odjeljenja za sudsku upravu za Odjel I i Odjel II.